فلایت کنترل  یک برد الکترونیکی نسبتاً کوچک است که شامل قسمت­های پیچیده و متنوع می­باشد، وظیفه این قطعه کنترل و تعیین میزان RPM (دور بر دقیقه) هر موتور است و در هر لحظه نسبت به دستورات ارسال شده از سوی خلبان واکنش نشان می­دهد.

کنترل کننده دستورات پرواز را از دستگاه گیرنده دریافت می­کند و پس از پردازش به کمک قطعه مربوطه به نام  ESC سرعت هریک از موتورها را مطابق با دستورات تغییر می­دهد، علاوه بر آن کنترل کننده­های پرواز قابل پیکربندی و برنامه­نویسی برای آنها تعریف شده است  تا بتوان فرآیندهای سفارشی سازی را با توجه به نوع پهپاد روی این قطعه پیاده نمایید.

حال با توجه به نوع کنترل کننده پرواز انتخاب شده نرم­افزارهایی متنوع برای نوشتن تنظیمات مورد نظر و اعمال آنها روی این قطعه وجود دارد که در حوزه پهپادهای کشاورزی توسط الگوریتم­های مبتنی بر هوش مصنوعی، این نوع پهپادها می­توانند محلول­پاشی دقیق و خودکار را انجام دهند.